single-cell

सिंगल-सेल के लिए सॉफ्टवेयर पैकेज और डेटा संसाधनों की समुदाय-क्यूरेटेड सूची, जिसमें RNA-seq, ATAC-seq, आदि शामिल हैं।

चिकित्सा अनुसंधान के लिए सैकड़ों एजेंट कौशल, जिसमें प्रोटोकॉल डिज़ाइन, डेटा विश्लेषण, साक्ष्य अंतर्दृष्टि और अकादमिक लेखन शामिल हैं।

https://www.sc-best-practices.org

bulk, single cell और spatial RNA-seq विश्लेषण सहित multi omics के लिए एक python लाइब्रेरी।

सेलेक्टिव अलाइनमेंट का उपयोग करके RNA-seq रीड्स से ट्रांसक्रिप्ट-लेवल क्वांटिफिकेशन के लिए अत्यधिक सटीक और तेज़ टूल।

scRNA-seq विश्लेषण टूल की एक सूची

सिंगल-सेल डेटा के व्यापक विश्लेषण और अन्वेषण की सुविधा के लिए डिज़ाइन किया गया एक एंड-टू-एंड सिंगल-सेल पाइपलाइन।

मल्टी-LLM सहमति का उपयोग करके सिंगल-सेल RNA-seq के लिए सेल टाइप एनोटेशन

pySCENIC, SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering) पाइपलाइन का एक अत्यंत तेज़ पायथन कार्यान्वयन है, जो जीवविज्ञानियों को सिंगल-सेल RNA-seq डेटा से ट्रांसक्रिप्शन कारकों, जीन नियामक नेटवर्क और सेल प्रकारों का अनुमान लगाने में सक्षम बनाता है।

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) उच्च-आयामी डेटा को विज़ुअलाइज़ करने के लिए एक टूल है

सभी omics से संबंधित बेहतरीन चीजों का संग्रह।

अर्ध-स्वचालित सेल प्रकार वर्गीकरण के लिए एक उपकरण