genomics

Analyse-Pipeline zur Erkennung von Keimbahn- oder somatischen Varianten (Vorverarbeitung, Variant Calling und Annotation) aus WGS- oder gezielten Sequenzierungsdaten.

Schnelle haploide Variantenbestimmung und Core-Genom-Alignment

Implementierung von Enformer, Deepminds Attention-Netzwerk zur Vorhersage der Genexpression, in Pytorch

Java-Dienstprogramme für die Bioinformatik

Eine Sammlung nützlicher Ressourcen rund um das Thema Omics.

Zusammenfassung, Analyse und Visualisierung von MAF-Dateien aus TCGA- oder internen Studien.