Thema · rna-seq

rna-seq

Erfasste Open-Source-Repos mit dem Tag rna-seq, sortiert nach Sternen.

Repos

8

Sterne gesamt

7.708

Sterne im Schnitt

964

Anteil

0,00%

Themen, die häufig gemeinsam mit rna-seq am selben Repo auftauchen.

Neue Aufsteiger

Repos, die in den letzten 90 Tagen erstellt und mit rna-seq getaggt wurden.

In den letzten 90 Tagen kam kein neues Repo mit diesem Thema dazu.

#1
rnaseq ↗@nf-coreNextflow
RNA-Sequenzierungs-Analysepipeline mit STAR, RSEM, HISAT2 oder Salmon inklusive Gen-/Isoform-Zählungen und umfangreicher Qualitätskontrolle.
★ 1.360+2Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#2
single-cell-best-practices ↗@theislabJupyter Notebook
https://www.sc-best-practices.org
★ 1.258+2Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#3
gget ↗@scversePython
🧬 gget ermöglicht die effiziente Abfrage genombasierter Referenzdatenbanken
★ 1.196+7Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#4
salmon ↗@COMBINE-labRust
🐟 🍣 🍱 Hochpräzise und extrem schnelle Quantifizierung auf Transkriptebene aus RNA-Seq-Reads mittels selektivem Alignment
★ 928+1Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#5
kallisto ↗@pachterlabC
Nahezu optimale RNA-Seq-Quantifizierung
★ 769+0Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#6
deepTools ↗@deeptoolsPython
Tools zur Verarbeitung und Analyse von Deep-Sequencing-Daten.
★ 765+2Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#7
PyDESeq2 ↗@scversePython
Eine Python-Implementierung der DESeq2-Pipeline für Bulk-RNA-Seq-DEA.
★ 760+0Sterne-Änderung der letzten 7 Tage
#8
nichenetr ↗@saeyslabR
NicheNet: Vorhersage aktiver Ligand-Ziel-Verbindungen zwischen interagierenden Zellen
★ 674+1Sterne-Änderung der letzten 7 Tage

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