single-cell

Von der Community kuratierte Liste von Softwarepaketen und Datenressourcen für Einzelzellen, einschließlich RNA-seq, ATAC-seq usw.

Hunderte von Agenten-Fähigkeiten für die medizinische Forschung, einschließlich Studiendesign, Datenanalyse, Evidenz-Einblicken und wissenschaftlichem Schreiben.

https://www.sc-best-practices.org

Eine Python-Bibliothek für Multi-Omics-Analysen, einschließlich Bulk-, Single-Cell- und spatialer RNA-Seq-Analysen.

🐟 🍣 🍱 Hochpräzise und extrem schnelle Quantifizierung auf Transkriptebene aus RNA-Seq-Reads mittels selektivem Alignment

Eine Liste von scRNA-seq-Analysetools

Eine End-to-End-Single-Cell-Pipeline zur Erleichterung der umfassenden Analyse und Erkundung von Einzelzell-Daten.

Zelltypanmerkung für Einzelzell-RNA-Seq unter Verwendung eines Multi-LLM-Konsenses

pySCENIC ist eine blitzschnelle Python-Implementierung der SCENIC-Pipeline (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering), die es Biologen ermöglicht, Transkriptionsfaktoren, Genregulationsnetzwerke und Zelltypen aus Single-Cell-RNA-Seq-Daten abzuleiten.

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) ist ein Werkzeug zur Visualisierung hochdimensionaler Daten.

Eine Sammlung nützlicher Ressourcen rund um das Thema Omics.

Ein Werkzeug zur halbautomatischen Zelltyp-Klassifizierung