single-cell

Lista curada por la comunidad de paquetes de software y recursos de datos para single-cell, incluyendo RNA-seq, ATAC-seq, etc.

Cientos de habilidades de agentes para investigación médica, incluyendo diseño de protocolos, análisis de datos, perspectivas de evidencia y redacción académica.

https://www.sc-best-practices.org

Una biblioteca de Python para análisis multi-ómica, incluyendo RNA-seq a granel, de célula única y espacial.

Cuantificación a nivel de transcrito altamente precisa y extremadamente rápida a partir de lecturas de RNA-seq mediante alineación selectiva

Una lista de herramientas de análisis scRNA-seq

Una tubería (pipeline) de extremo a extremo para células individuales diseñada para facilitar el análisis y la exploración integral de datos de células individuales.

Anotación de tipos celulares para RNA-seq de célula única mediante consenso de múltiples LLM.

pySCENIC es una implementación en Python extremadamente rápida del pipeline SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering), que permite a los biólogos inferir factores de transcripción, redes de regulación génica y tipos celulares a partir de datos de RNA-seq de célula única.

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Una colección de recursos increíbles sobre todas las ciencias ómicas.

Una herramienta para la clasificación semiautomática de tipos celulares