Tema · rna-seq

rna-seq

Repositorios de código abierto monitorizados etiquetados con rna-seq, ordenados por estrellas.

Repositorios

8

Estrellas totales

7708

Estrellas de media

964

Proporción

0,00%

Temas que aparecen con frecuencia junto a rna-seq en un mismo repositorio.

Emergentes recientes

Repositorios creados en los últimos 90 días, etiquetados con rna-seq.

No hay repositorios nuevos con este tema en los últimos 90 días.

#1
rnaseq ↗@nf-coreNextflow
Pipeline de análisis de secuenciación de ARN usando STAR, RSEM, HISAT2 o Salmon con conteo de genes/isoformas y control de calidad exhaustivo.
★ 1360+2Variación de estrellas de los últimos 7 días
#2
single-cell-best-practices ↗@theislabJupyter Notebook
https://www.sc-best-practices.org
★ 1258+2Variación de estrellas de los últimos 7 días
#3
gget ↗@scversePython
🧬 gget permite realizar consultas eficientes a bases de datos de referencia genómica.
★ 1196+7Variación de estrellas de los últimos 7 días
#4
salmon ↗@COMBINE-labRust
Cuantificación a nivel de transcrito altamente precisa y extremadamente rápida a partir de lecturas de RNA-seq mediante alineación selectiva
★ 928+1Variación de estrellas de los últimos 7 días
#5
kallisto ↗@pachterlabC
Cuantificación de RNA-Seq casi óptima.
★ 769+0Variación de estrellas de los últimos 7 días
#6
deepTools ↗@deeptoolsPython
Herramientas para procesar y analizar datos de secuenciación profunda.
★ 765+2Variación de estrellas de los últimos 7 días
#7
PyDESeq2 ↗@scversePython
Una implementación en Python del pipeline DESeq2 para DEA de RNA-seq masivo
★ 760+0Variación de estrellas de los últimos 7 días
#8
nichenetr ↗@saeyslabR
NicheNet: predice enlaces activos ligando-objetivo entre células que interactúan.
★ 674+1Variación de estrellas de los últimos 7 días

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