transcriptomics

Análisis de células individuales en Python. Escalable a >100 millones de células.

🧬 gget permite realizar consultas eficientes a bases de datos de referencia genómica.

Modelos fundamentales para genómica y transcriptómica.

Un explorador interactivo para datos de transcriptómica de célula única

Datos anotados.

Una implementación en Python del pipeline DESeq2 para DEA de RNA-seq masivo

pySCENIC es una implementación en Python extremadamente rápida del pipeline SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering), que permite a los biólogos inferir factores de transcripción, redes de regulación génica y tipos celulares a partir de datos de RNA-seq de célula única.