reproducible-research

Une collection d'auto-encodeurs variationnels (VAE) en PyTorch.

Sacred est un outil développé à l'IDSIA pour aider à configurer, organiser, journaliser et reproduire des expériences.

Atelier de recherche en IA open-source avec agents scientifiques pour une recherche et une découverte reproductibles.

🔬 Une collection organisée de plus de 23 000 compétences d'agents pour la recherche empirique dans 8 disciplines des sciences sociales. Maintenu par CoPaper.AI de Stanford REAP.

Un DSL pour les pipelines de calcul pilotés par les données

Évaluation de l'état de l'art en IA

Unification des implémentations de Variational Autoencoder (VAE) dans Pytorch (NeurIPS 2022).

Insight Toolkit (ITK) -- Dépôt officiel. ITK repose sur une architecture éprouvée orientée vers l'espace pour le traitement, la segmentation et l'enregistrement d'images scientifiques en deux, trois dimensions ou plus.

Sionna : Une bibliothèque open source pour la recherche sur les systèmes de communication

Open Science Desktop — atelier de recherche IA local et agnostique aux modèles pour macOS, Windows et Linux. Alternative open-source à Claude Science construite sur Tauri + MCP + compétences d'agent.

Un modèle Claude Code prêt à être forké pour les universitaires utilisant LaTeX/Beamer + R. Inclut une revue multi-agents, des contrôles de qualité, du QA contradictoire et des protocoles de réplication.

Une boîte à outils de pipeline axée sur R pour la reproductibilité et le calcul haute performance

Tableaux de synthèse de données et de résultats analytiques prêts pour la présentation

Métriques de performance haute fidélité pour les modèles génératifs sous PyTorch.

Atelier de recherche IA open source, local-first, pour le calcul scientifique avec Python/R, outils bioinformatiques MCP, runtimes SSH/WSL/GPU et modèles OpenAI/Anthropic.

PyCIL : une boîte à outils Python pour l'apprentissage incrémental de classes.

Workflows déclaratifs orientés fonction de type Make pour R

Code accompagnant notre article Chen et Zimmermann (2020), "Open source cross-sectional asset pricing".

Rapports scientifiques et programmation lettrée pour Julia

Un outil de recherche pour le dilemme du prisonnier itéré.

GPU-Jupyter : votre JupyterLab accéléré par GPU avec une riche pile d'outils de science des données, TensorFlow et PyTorch pour vos expériences d'apprentissage profond reproductibles.

rrtools : Outils pour la rédaction de recherche reproductible en R

papaja (Preparing APA Journal Articles) est un package R fournissant des formats de documents pour générer des manuscrits APA complets à partir de fichiers RMarkdown (documents PDF et Word) ainsi que des fonctions utilitaires pour faciliter la présentation des statistiques, des tableaux et des graphiques.

Un flux de travail pour des articles scientifiques reproductibles et ouverts.

Une interface Python élégante pour la visualisation sur la plateforme web afin de générer de manière interactive des aperçus sur des images multidimensionnelles, des ensembles de points et de la géométrie.

🎉 PILOT : Une boîte à outils d'apprentissage continu basée sur des modèles pré-entraînés.

Pipeline d'analyse pour détecter les variants germinaux ou somatiques (prétraitement, appel de variants et annotation) à partir de séquençage WGS ou ciblé

A platform-neutral analytical Skill that profiles messy data, selects case-adaptive methods, and produces source-backed visual reports for high-stakes decisions.