bioinformatics

Data beranotasi.

Alat untuk memproses dan menganalisis data deep sequencing.

Implementasi Python dari pipeline DESeq2 untuk DEA RNA-seq massal.

Alat sumber terbuka serbaguna untuk analisis mikrobioma

Bekerja dengan struktur molekul di pandas DataFrame

Paket Go untuk rekayasa organisme.

Perakit (meta-)genom yang sangat cepat dan efisien memori.

Protein-Ligand Interaction Profiler - Menganalisis dan memvisualisasikan interaksi protein-ligan non-kovalen dalam file PDB menurut 📝 Schake, Bolz, et al. (2025), https://doi.org/10.1093/nar/gkaf361

:eye: Pustaka Python untuk memplot fitur sekuens DNA (misalnya dari file Genbank)

Pemanggil variasi struktural menggunakan sekuensing generasi ketiga

Visualisasi jaringan interaktif di Python dan Dash, didukung oleh Cytoscape.js

Anotasi yang cepat & terstandarisasi untuk genom bakteri, MAG & plasmid

ScienceClaw adalah asisten peneliti pribadi yang dibangun dengan infrastruktur LangChain DeepAgents dan AIO Sandbox, mengadopsi arsitektur baru yang melampaui OpenClaw. Menawarkan keamanan yang lebih kuat, transparansi yang lebih baik, dan pengalaman yang lebih ramah pengguna.

Anotasi tipe sel untuk RNA-seq sel tunggal menggunakan konsensus multi-LLM

Pembuat gambar perbandingan kluster gen

Pustaka yang kompatibel dengan scikit-learn untuk kernel graf.

:book::microscope::coffee: BioJava adalah proyek open-source yang didedikasikan untuk menyediakan pustaka Java guna memproses data biologis.

Suite deteksi homologi protein jarak jauh.

BioMCP: Protokol Konteks Model Biomedis.

GTDB-Tk: toolkit untuk menetapkan klasifikasi taksonomi objektif pada genom bakteri dan archaea.

Alat untuk bekerja dengan data SAM/BAM

Pustaka C/C++ (& Python) yang ringan dan sangat cepat untuk perataan sekuens menggunakan jarak edit (Levenshtein).

The Chemistry Development Kit

Pipeline analisis untuk mendeteksi varian germline atau somatik (pra-pemrosesan, pemanggilan varian, dan anotasi) dari WGS / pengurutan bertarget

Satu lagi mesin alur kerja yang redundan

Pemanggilan varian haploid dan penyejajaran genom inti yang cepat

Tanya Jawab Biostar

Cutadapt menghapus urutan adaptor dari pembacaan sekuensing

COBRApy adalah paket untuk pemodelan jaringan metabolisme berbasis batasan.

Komponen bioinformatika sumber terbuka untuk Dash