Topik · genomics

genomics

Repositori open source terpantau bertanda genomics, diurutkan berdasarkan bintang.

Repositori

Total bintang

79.874

Rata-rata bintang

2.219

Porsi

0,00%

Topik yang sering muncul berdampingan dengan genomics di repositori yang sama.

Yang sedang naik

Repositori yang dibuat dalam 90 hari terakhir dan bertanda genomics.

Tidak ada repositori baru bertanda topik ini dalam 90 hari terakhir.

#1
scientific-agent-skills ↗@K-Dense-AIPython
Ubah agen AI apa pun menjadi AI Scientist. Pustaka Keterampilan Agen #1 untuk sains, digunakan oleh lebih dari 175.000 ilmuwan di seluruh dunia. Berisi 163 keterampilan tervalidasi yang siap pakai serta 100+ basis data ilmiah yang mencakup biologi, kimia, kedokteran, dan penemuan obat. Kompatibel dengan Cursor, Claude Code, Codex, Pi, Antigravity, dan standar Agent Skills terbuka.
★ 37.886+3.798Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#2
biopython ↗@biopythonPython
Repositori git resmi untuk Biopython (awalnya dikonversi dari CVS).
★ 5.177+11Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#3
deepvariant ↗@googlePython
DeepVariant adalah pipeline analisis yang menggunakan jaringan saraf dalam untuk memanggil varian genetik dari data pengurutan DNA generasi berikutnya.
★ 3.795+10Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#4
minimap2 ↗@lh3C
Penyelarasan berpasangan serbaguna untuk urutan nukleotida genomik dan spliced.
★ 2.242+6Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#5
gatk ↗@broadinstituteJava
Repositori kode resmi untuk GATK versi 4 ke atas
★ 1.993+6Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#6
galaxy ↗@galaxyprojectPython
Sains intensif data untuk semua orang.
★ 1.841+3Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#7
medical-research-skills ↗@aipochPython
Ratusan keterampilan agen untuk penelitian medis, termasuk desain protokol, analisis data, wawasan bukti, dan penulisan akademis.
★ 1.785+38Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#8
bwa ↗@lh3C
Burrow-Wheeler Aligner untuk penyelarasan bacaan pendek (lihat minimap2 untuk penyelarasan bacaan panjang)
★ 1.766+2Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#9
vg ↗@vgteamC++
alat untuk bekerja dengan graf variasi genom
★ 1.334+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#10
gget ↗@scversePython
🧬 gget memungkinkan kueri basis data referensi genomik yang efisien
★ 1.190+2Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#11
ClawBio ↗@ClawBioPython
🦖 ClawBio - Pustaka keterampilan agen AI asli bioinformatika pertama. Berbasis lokal. Dapat direproduksi. Terbuka. Gratis.
★ 1.121+8Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#12
pyCirclize ↗@moshi4Python
Visualisasi melingkar dengan Python (Circos Plot, Chord Diagram, Radar Chart)
★ 1.117+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#13
ncbi-genome-download ↗@kblinPython
Skrip untuk mengunduh genom dari server NCBI FTP
★ 1.083+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#14
hail ↗@hail-isPython
Dataframe genomik native cloud dan komputasi batch
★ 1.070+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#15
mirobody ↗@thetahealthPython
Mesin data kesehatan native AI — mengumpulkan, menstandarisasi, dan menganalisis data laboratorium, perangkat wearabel, & genomik.
★ 1.061+3Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#16
adam ↗@bigdatagenomicsScala
ADAM adalah platform analisis genom dengan format file khusus yang dibangun menggunakan Apache Avro, Apache Spark, dan Apache Parquet. Berlisensi Apache 2.
★ 1.058+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#17
jcvi ↗@tanghaibaoPython
Pustaka Python untuk memfasilitasi perakitan genom, anotasi, dan genomik komparatif
★ 928+2Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#18
nucleotide-transformer ↗@instadeepaiJupyter Notebook
Model fondasi untuk genomik & transkriptomik
★ 913+4Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#19
goatools ↗@tanghaibaoPython
Pustaka Python untuk menangani istilah Gene Ontology (GO)
★ 907+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#20
dorado ↗@nanoporetechC++
Basecaller dari Oxford Nanopore
★ 867+6Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#21
bwa-mem2 ↗@bwa-mem2C++
Versi berikutnya dari bwa-mem
★ 858+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#22
bowtie2 ↗@BenLangmeadC++
Penyelaras baca gapped yang cepat dan sensitif
★ 811+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#23
hifiasm ↗@chhylp123C++
Hifiasm: perakit beresolusi haplotip untuk pembacaan Hifi yang akurat
★ 808+3Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#24
hyena-dna ↗@HazyResearchAssembly
Implementasi resmi untuk HyenaDNA, model fondasi genomik jarak jauh yang dibangun dengan Hyena
★ 808+4Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#25
eggnog-mapper ↗@eggnogdbPython
Anotasi fungsional genomik cepat melalui penugasan ortologi
★ 772+7Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#26
deepTools ↗@deeptoolsPython
Alat untuk memproses dan menganalisis data deep sequencing.
★ 763+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#27
megahit ↗@voutcnC++
Perakit (meta-)genom yang sangat cepat dan efisien memori.
★ 722+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#28
vcflib ↗@vcflibC++
Pustaka C++ dan alat baris perintah untuk mengurai dan memanipulasi file VCF dengan binding python dan zig
★ 684+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#29
biojava ↗@biojavaJava
:book::microscope::coffee: BioJava adalah proyek open-source yang didedikasikan untuk menyediakan pustaka Java guna memproses data biologis.
★ 631+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#30
biomcp ↗@genomoncologyRust
BioMCP: Protokol Konteks Model Biomedis.
★ 617+13Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir

← Kembali ke topik

Topik terkait

Yang sedang naik