Topik · rna-seq

rna-seq

Repositori open source terpantau bertanda rna-seq, diurutkan berdasarkan bintang.

Repositori

8

Total bintang

7.708

Rata-rata bintang

964

Porsi

0,00%

Topik yang sering muncul berdampingan dengan rna-seq di repositori yang sama.

Yang sedang naik

Repositori yang dibuat dalam 90 hari terakhir dan bertanda rna-seq.

Tidak ada repositori baru bertanda topik ini dalam 90 hari terakhir.

#1
rnaseq ↗@nf-coreNextflow
Pipeline analisis sekuensing RNA menggunakan STAR, RSEM, HISAT2 atau Salmon dengan jumlah gen/isoform dan kontrol kualitas yang ekstensif.
★ 1.360+3Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#2
single-cell-best-practices ↗@theislabJupyter Notebook
https://www.sc-best-practices.org
★ 1.258+4Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#3
gget ↗@scversePython
🧬 gget memungkinkan kueri basis data referensi genomik yang efisien
★ 1.196+7Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#4
salmon ↗@COMBINE-labRust
🐟 🍣 🍱 Kuantifikasi tingkat transkrip dari pembacaan RNA-seq yang sangat akurat dan sangat cepat menggunakan alignment selektif
★ 928+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#5
kallisto ↗@pachterlabC
Kuantifikasi RNA-Seq yang mendekati optimal
★ 769+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#6
deepTools ↗@deeptoolsPython
Alat untuk memproses dan menganalisis data deep sequencing.
★ 765+0Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#7
PyDESeq2 ↗@scversePython
Implementasi Python dari pipeline DESeq2 untuk DEA RNA-seq massal.
★ 760-1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir
#8
nichenetr ↗@saeyslabR
NicheNet: memprediksi tautan ligan-target aktif antar sel yang berinteraksi
★ 674+1Perubahan bintang dalam 7 hari terakhir

← Kembali ke topik