phylogenetics

Biopythonの公式gitリポジトリ（元はCVSから変換）。

ツリーの構築、比較、注釈付け、操作、および視覚化を行うためのPythonパッケージ。NCBI分類ツリーを操作するユーティリティを含む、包括的なAPIとコマンドラインツールのコレクションを提供します。

GTDB-Tk: バクテリアおよびアーキアのゲノムに客観的な分類学的割当を行うためのツールキット。