bioinformatics

ビデオ講義付きのコンピュータサイエンスコース一覧。

あらゆるAIエージェントをAIサイエンティストに変える。世界中の175,000人以上の科学者が利用する、科学分野No.1のエージェントスキルライブラリ。生物学、化学、医学、創薬を網羅する163の即用可能な検証済みスキルと100以上の科学データベースを提供。Cursor、Claude Code、Codex、Pi、Antigravity、およびオープンなAgent Skills標準と互換性があります。

Python用のデータアプリケーションとダッシュボード。JavaScriptは不要。

Biopythonの公式gitリポジトリ（元はCVSから変換）。

優れたバイオインフォマティクスライブラリとソフトウェアの厳選リスト。

再現性のある研究と発見を支える科学エージェントを備えた、オープンソースのAI研究ワークベンチ。

RNA-seq、ATAC-seqなど、シングルセル向けのソフトウェアパッケージとデータリソースのコミュニティキュレーションリスト。

DeepVariantは、次世代DNAシーケンシングデータから遺伝的バリアントをコールするために深層ニューラルネットワークを使用する解析パイプラインです。

科学研究のためのオープンソース AI ワークベンチ

データ駆動型計算パイプラインのためのDSL

タンパク質構造予測を誰でも手軽に！

Pythonによるシングルセル解析。1億を超える細胞へのスケーラビリティに対応。

超高速なオールインワンFASTQ前処理ツール（QC/アダプター/トリミング/フィルタリング/分割/マージ...）

ゲノムおよびスプライスされたヌクレオチド配列のための多用途なペアワイズアライナー

MMseqs2：超高速かつ高感度な検索・クラスタリングスイート

GATK バージョン 4 以降の公式コードリポジトリ

科学・生物医学文書向けの完全なspaCyパイプラインおよびモデル。

物理学、化学から生物学、マテリアル科学などに至るまで、科学的発見を加速する優れた AI ツール、ライブラリ、論文、データセット、フレームワークのキュレーションリスト。

biocondaチャンネル用のCondaレシピ。

すべての人のためのデータ集約型科学

プロトコル設計、データ分析、エビデンスの洞察、学術執筆など、医学研究向けの数百のAIエージェント用スキル。

ショートリードのアラインメント用 Burrow-Wheeler Aligner（ロングリードのアラインメントについては minimap2 を参照）

FASTA/Qファイル操作のためのクロスプラットフォームかつ超高速なツールキット

FASTA/Q形式の配列を処理するためのツールキット

多数のサンプルにわたるバイオインフォマティクス解析の結果を集約し、単一のレポートを出力します。

ゲノミクスおよびデータサイエンスのための Unix、R、Python ツール

Foldseekにより、大規模な構造セットの高速かつ高感度な比較が可能になります

Therapeutics Commons (TDC): 治療科学のためのマルチモーダル基盤

scikit-bio：多様なデータ構造、アルゴリズム、教育リソースを提供する、コミュニティ主導のバイオインフォマティクス向け Python ライブラリ

バルク、シングルセル、空間RNA-seq解析を含むマルチオミクス解析用のPythonライブラリ