single-cell

RNA-seq、ATAC-seqなど、シングルセル向けのソフトウェアパッケージとデータリソースのコミュニティキュレーションリスト。

プロトコル設計、データ分析、エビデンスの洞察、学術執筆など、医学研究向けの数百のAIエージェント用スキル。

https://www.sc-best-practices.org

バルク、シングルセル、空間RNA-seq解析を含むマルチオミクス解析用のPythonライブラリ

🐟 🍣 🍱 選択的アライメントを用いた、RNA-seq リードからの高精度かつ超高速なトランスクリプトレベルの定量化ツール

scRNA-seq解析ツールのリスト

シングルセルデータの包括的な分析と探索を容易にするために設計されたエンドツーエンドのシングルセルパイプライン。

マルチLLMの合意形成を用いたシングルセルRNA-seqの細胞型アノテーション。

pySCENIC は SCENIC パイプライン（Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering）の超高速な Python 実装であり、生物学者が単一細胞 RNA-seq データから転写因子、遺伝子制御ネットワーク、細胞タイプを推論できるようにします

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) は、高次元データを視覚化するためのツールです。

あらゆるオミクスに関する素晴らしいもののコレクション

半自動細胞型分類ツール