single-cell

Lista com curadoria da comunidade de pacotes de software e recursos de dados para célula única, incluindo RNA-seq, ATAC-seq, etc.

Centenas de habilidades de agentes para pesquisa médica, incluindo design de protocolos, análise de dados, insights de evidências e escrita acadêmica.

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Uma biblioteca Python para análise multi-ômica, incluindo RNA-seq em massa, célula única e espacial.

🐟 🍣 🍱 Quantificação de nível de transcrito altamente precisa e extremamente rápida a partir de leituras de RNA-seq usando alinhamento seletivo

Uma lista de ferramentas de análise de scRNA-seq

Um pipeline de célula única de ponta a ponta projetado para facilitar a análise abrangente e a exploração de dados de célula única.

Anotação de tipo de célula para RNA-seq de célula única usando consenso de múltiplos LLM

pySCENIC é uma implementação em Python extremamente rápida do pipeline SCENIC (Inferência de Rede Regulatória de Célula Única e Agrupamento) que permite aos biólogos inferir fatores de transcrição, redes regulatórias gênicas e tipos celulares a partir de dados de RNA-seq de célula única.

PHATE (Potencial de Difusão de Calor para Incorporação de Transição Baseada em Afinidade) é uma ferramenta para visualização de dados de alta dimensão.

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Uma ferramenta para classificação semiautomática de tipos celulares