Tópico · transcriptomics

transcriptomics

Repositórios de código aberto acompanhados marcados com transcriptomics, ordenados por estrelas.

Repositórios

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Tópicos que aparecem com frequência ao lado de transcriptomics no mesmo repositório.

Em ascensão recentemente

Repositórios criados nos últimos 90 dias e marcados com transcriptomics.

Nenhum repositório novo marcado com este tópico nos últimos 90 dias.

#1
scanpy ↗@scversePython
Análise de célula única em Python. Escala para mais de 100 milhões de células.
★ 2.551+6Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#2
gget ↗@scversePython
🧬 O gget permite consultas eficientes a bancos de dados de referência genômica
★ 1.196+2Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#3
nucleotide-transformer ↗@instadeepaiJupyter Notebook
Modelos Fundacionais para Genômica e Transcriptômica
★ 915+4Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#4
cellxgene ↗@chanzuckerbergJavaScript
Um explorador interativo para dados de transcriptômica de célula única.
★ 784+2Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#5
anndata ↗@scversePython
Dados anotados.
★ 768+3Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#6
PyDESeq2 ↗@scversePython
Uma implementação em Python do pipeline DESeq2 para DEA de RNA-seq em massa.
★ 760+0Variação de estrelas nos últimos 7 dias
#7
pySCENIC ↗@aertslabPython
pySCENIC é uma implementação em Python extremamente rápida do pipeline SCENIC (Inferência de Rede Regulatória de Célula Única e Agrupamento) que permite aos biólogos inferir fatores de transcrição, redes regulatórias gênicas e tipos celulares a partir de dados de RNA-seq de célula única.
★ 633-1Variação de estrelas nos últimos 7 dias