single-cell

Danh sách do cộng đồng tuyển chọn gồm các gói phần mềm và tài nguyên dữ liệu cho single-cell, bao gồm RNA-seq, ATAC-seq, v.v.

Hàng trăm kỹ năng tác nhân dành cho nghiên cứu y tế, bao gồm thiết kế giao thức, phân tích dữ liệu, thông tin chi tiết về bằng chứng và viết học thuật.

https://www.sc-best-practices.org

Thư viện Python hỗ trợ phân tích đa omics bao gồm bulk, single cell và RNA-seq không gian.

🐟 🍣 🍱 Định lượng cấp bản ghi chính xác cao và cực nhanh từ dữ liệu đọc RNA-seq bằng cách sử dụng căn chỉnh chọn lọc

Danh sách các công cụ phân tích scRNA-seq

Một quy trình Single-Cell toàn diện được thiết kế để hỗ trợ phân tích và khám phá dữ liệu đơn bào.

Chú giải loại tế bào cho RNA-seq đơn bào sử dụng sự đồng thuận của nhiều LLM

pySCENIC là bản triển khai Python cực nhanh của quy trình SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering), cho phép các nhà sinh học suy luận các yếu tố phiên mã, mạng lưới điều hòa gen và các loại tế bào từ dữ liệu RNA-seq đơn bào.

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) là một công cụ để trực quan hóa dữ liệu đa chiều.

Bộ sưu tập các tài nguyên tuyệt vời liên quan đến tất cả các lĩnh vực omics.

Công cụ phân loại loại tế bào bán tự động