bioinformatics

Danh sách các khóa học Khoa học Máy tính có kèm video bài giảng.

Biến bất kỳ AI agent nào thành một Nhà khoa học AI. Thư viện Kỹ năng Agent hàng đầu dành cho khoa học, được hơn 175.000 nhà khoa học trên toàn thế giới sử dụng. 163 kỹ năng đã được xác thực sẵn sàng sử dụng cùng hơn 100 cơ sở dữ liệu khoa học bao gồm sinh học, hóa học, y học và khám phá thuốc. Tương thích với Cursor, Claude Code, Codex, Pi, Antigravity và tiêu chuẩn Agent Skills mở.

Ứng dụng dữ liệu & Dashboard cho Python. Không cần JavaScript.

Kho lưu trữ Git chính thức cho Biopython (ban đầu được chuyển đổi từ CVS)

Danh sách tổng hợp các thư viện và phần mềm Tin sinh học tuyệt vời.

Bàn làm việc nghiên cứu AI mã nguồn mở với các tác nhân khoa học dành cho nghiên cứu và khám phá có thể tái tạo.

Danh sách do cộng đồng tuyển chọn gồm các gói phần mềm và tài nguyên dữ liệu cho single-cell, bao gồm RNA-seq, ATAC-seq, v.v.

DeepVariant là một chu trình phân tích sử dụng mạng nơ-ron sâu để gọi các biến thể di truyền từ dữ liệu giải trình tự DNA thế hệ mới.

Bàn làm việc AI mã nguồn mở dành cho nghiên cứu khoa học

Một DSL dành cho các pipeline tính toán hướng dữ liệu

Làm cho việc dự đoán cấu trúc protein trở nên dễ tiếp cận với tất cả mọi người!

Phân tích đơn bào (single-cell) bằng Python. Mở rộng quy mô lên tới >100 triệu tế bào.

Trình tiền xử lý FASTQ tất cả trong một siêu nhanh (QC/adapters/trimming/filtering/splitting/merging...)

Một công cụ căn chỉnh cặp (pairwise aligner) linh hoạt cho các trình tự bộ gen và nucleotide ghép nối.

MMseqs2: bộ công cụ tìm kiếm và phân cụm cực nhanh và nhạy

Kho mã chính thức cho GATK phiên bản 4 trở lên

Một pipeline và các mô hình spaCy đầy đủ dành cho tài liệu khoa học/y sinh.

Danh sách chọn lọc các công cụ, thư viện, tài liệu, tập dữ liệu và framework AI tuyệt vời giúp tăng tốc khám phá khoa học — từ vật lý, hóa học đến sinh học, vật liệu và hơn thế nữa.

Công thức Conda cho kênh bioconda.

Khoa họcintensive dữ liệu cho mọi người.

Hàng trăm kỹ năng tác nhân dành cho nghiên cứu y tế, bao gồm thiết kế giao thức, phân tích dữ liệu, thông tin chi tiết về bằng chứng và viết học thuật.

Burrow-Wheeler Aligner để căn chỉnh chuỗi ngắn (xem minimap2 để căn chỉnh chuỗi dài)

Bộ công cụ đa nền tảng và siêu nhanh để xử lý tệp FASTA/Q

Bộ công cụ xử lý chuỗi ở định dạng FASTA/Q

Tổng hợp kết quả từ các phân tích tin sinh học trên nhiều mẫu vào một báo cáo duy nhất.

Các công cụ Unix, R và Python cho khoa học dữ liệu và hệ gen học.

Foldseek cho phép so sánh nhanh chóng và nhạy bén các tập cấu trúc lớn

Therapeutics Commons (TDC): Nền tảng đa phương thức cho khoa học trị liệu

scikit-bio: thư viện Python do cộng đồng phát triển dành cho tin sinh học, cung cấp các cấu trúc dữ liệu, thuật toán và tài nguyên giáo dục đa năng.

Thư viện Python hỗ trợ phân tích đa omics bao gồm bulk, single cell và RNA-seq không gian.