bioinformatics

Thư viện Đồ thị Protein

Bộ công cụ Deep Learning cho DTI, tính chất thuốc, PPI, DDI, dự đoán chức năng protein (Tin sinh học)

Bộ công cụ CSV/TSV đa nền tảng, hiệu quả và thiết thực bằng Golang

Công cụ dòng lệnh đa nền tảng để thực thi các tác vụ song song

🦖 ClawBio - Thư viện kỹ năng tác nhân AI gốc về sinhinformatics đầu tiên. Ưu tiên cục bộ. Có thể tái tạo. Mở. Miễn phí.

Một đồng nghiệp khoa học AI chạy trên máy tính để bàn của bạn. Claude Science nhưng tốt hơn.

Trực quan hóa hình tròn trong Python (Circos Plot, Chord Diagram, Radar Chart)

Các pipeline mạnh mẽ, linh hoạt và tiết kiệm tài nguyên sử dụng Go và dòng lệnh

Bàn làm việc nghiên cứu AI trên máy tính để bàn mã nguồn mở, ưu tiên cục bộ dành cho tính toán khoa học với Python/R, công cụ tin sinh học MCP, môi trường thực thi SSH/WSL/GPU và các mô hình OpenAI/Anthropic.

Một thành phần React cho plotly.js từ Plotly 📈

Các tập lệnh để tải xuống bộ gen từ máy chủ NCBI FTP

Công cụ quy trình công việc khoa học được thiết kế để đơn giản hóa và mở rộng. Dễ dàng chuyển đổi giữa các trường hợp sử dụng đơn lẻ sang môi trường sản xuất quy mô lớn

Khung dữ liệu bộ gen gốc đám mây và tính toán hàng loạt

ADAM là nền tảng phân tích bộ gen với các định dạng file chuyên biệt được xây dựng bằng Apache Avro, Apache Spark và Apache Parquet. Cấp phép theo Apache 2.

Thư viện toàn diện cho sinh học phân tử tính toán.

Thư viện C cho các định dạng dữ liệu giải trình tự thông lượng cao

Trao quyền cho các Mô hình Ngôn ngữ Lớn (LLM) bằng Truy xuất tăng cường thế hệ dựa trên Đồ thị Tri thức (KG-RAG) cho các tác vụ cần nhiều tri thức

🐟 🍣 🍱 Định lượng cấp bản ghi chính xác cao và cực nhanh từ dữ liệu đọc RNA-seq bằng cách sử dụng căn chỉnh chọn lọc

Thư viện Python hỗ trợ lắp ráp bộ gen, chú thích và bộ gen so sánh.

Pysam là một gói Python dùng để đọc, thao tác và ghi dữ liệu genomics như các tệp SAM/BAM/CRAM và VCF/BCF. Đây là một trình bao bọc nhẹ của API HTSlib, công nghệ đằng sau samtools, bcftools và tabix.

Một cộng sự nghiên cứu AI tự phát triển dành cho các nhà khoa học. 285 kỹ năng, không ảo giác, bộ nhớ bền bỉ.

Danh sách tổng hợp các thư viện và phần mềm tin học hóa học (Cheminformatics).

Phiên bản tiếp theo của bwa-mem

Đặc tả cho Ngôn ngữ mô tả quy trình làm việc (WDL).

Đồ thị tri thức y học chính xác (PrimeKG).

Kiểu hình thực vật với phân tích hình ảnh.

Trình căn chỉnh đọc gapped nhanh và nhạy.

Các container dành cho tin sinh học.

Hifiasm: trình lắp ráp phân giải haplotype cho các bản đọc Hifi chính xác

Đếm k-mer trình tự nucleotide trong bộ nhớ, lọc, duyệt đồ thị và hơn thế nữa.