single-cell

社群策劃的單細胞軟體包與資料資源清單，包括RNA-seq、ATAC-seq等

數百個用於醫學研究的代理人技能，包含協議設計、資料分析、證據洞察與學術寫作。

https://www.sc-best-practices.org

一個用於多組學（包含大量、單細胞與空間 RNA-seq 分析）的 Python 函式庫。

🐟 🍣 🍱 使用選擇性比對技術，從 RNA-seq 讀取資料進行極度精準且超快速的轉錄本層級定量分析

scRNA-seq 分析工具列表

一個端到端的單細胞管線，旨在促進單細胞資料的全面分析與探索。

使用多 LLM 共識進行單細胞 RNA-seq 的細胞類型註釋

pySCENIC 是 SCENIC 管道（單細胞調控網路推斷與分群）的極速 Python 實現，使生物學家能夠從單細胞 RNA-seq 資料中推斷轉錄因子、基因調控網路與細胞類型。

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) 是一款用於視覺化高維資料的工具。

關於所有組學 (Omics) 的精選資源集合。

一種用於半自動細胞類型分類的工具