bioinformatics

Protein Graph Library

Ein Deep-Learning-Toolkit für DTI, Eigenschaftsvorhersage von Medikamenten, PPI, DDI und Proteinfunktionsvorhersage (Bioinformatik)

Ein plattformübergreifendes, effizientes und praktisches CSV/TSV-Toolkit in Golang

Ein plattformübergreifendes Befehlszeilentool zur parallelen Ausführung von Jobs

🦖 ClawBio – Die erste Bioinformatik-native KI-Agenten-Skill-Bibliothek. Local-first. Reproduzierbar. Offen. Kostenlos.

Ein KI-Co-Wissenschaftler, der auf Ihrem Desktop läuft. Claude Science, nur besser.

Zirkuläre Visualisierung in Python (Circos-Plot, Chord-Diagramm, Netzdiagramm)

Robuste, flexible und ressourceneffiziente Pipelines mit Go und der Befehlszeile

Eine plotly.js React-Komponente von Plotly 📈

Open-Source, lokal basierter Desktop-KI-Forschungsarbeitsplatz für wissenschaftliches Rechnen mit Python/R, MCP-Bioinformatik-Tools, SSH/WSL/GPU-Runtimes und OpenAI/Anthropic-Modellen.

Skripte zum Herunterladen von Genomen von den NCBI-FTP-Servern

Wissenschaftliche Workflow-Engine, entwickelt für Einfachheit und Skalierbarkeit. Müheloser Übergang von einmaligen Anwendungsfällen zu massiven Produktionsumgebungen.

Cloud-native genomische Dataframes und Batch-Computing

ADAM ist eine Genomanalyse-Plattform mit spezialisierten Dateiformaten, entwickelt unter Verwendung von Apache Avro, Apache Spark und Apache Parquet. Lizenziert unter Apache 2.

Eine umfassende Bibliothek für Computergestützte Molekularbiologie

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

Unterstützung von Large Language Models (LLM) durch Knowledge Graph-basierte Retrieval-Augmented Generation (KG-RAG) für wissensintensive Aufgaben

🐟 🍣 🍱 Hochpräzise und extrem schnelle Quantifizierung auf Transkriptebene aus RNA-Seq-Reads mittels selektivem Alignment

Python-Bibliothek zur Erleichterung von Genomassemblierung, -annotation und vergleichender Genomik

Pysam ist ein Python-Paket zum Lesen, Bearbeiten und Schreiben von Genomdaten wie SAM/BAM/CRAM- und VCF/BCF-Dateien. Es ist ein schlanker Wrapper der HTSlib-API, die auch samtools, bcftools und tabix antreibt.

🔬🦞 Ein sich selbst weiterentwickelnder KI-Forschungskollege für Wissenschaftler. 285 Fähigkeiten, null Halluzinationen, permanenter Speicher.

Eine kuratierte Liste von Cheminformatik-Bibliotheken und -Software.

Die nächste Version von bwa-mem

Spezifikation für die Workflow Description Language (WDL).

Wissensgraph für Präzisionsmedizin (PrimeKG).

Pflanzenphänotypisierung mit Bildanalyse

Ein schneller und sensitiver Gapped-Read-Aligner

Hifiasm: ein Haplotype-aufgelöster Assembler für präzise Hifi-Reads

Bioinformatik-Container

In-Memory-Nukleotidsequenz-k-mer-Zählung, -Filterung, -Graphentraversierung und mehr