bioinformatics

Biblioteca de grafos de proteínas.

Un kit de herramientas de aprendizaje profundo para DTI, propiedades de fármacos, PPI, DDI y predicción de funciones de proteínas (bioinformática)

Un kit de herramientas CSV/TSV multiplataforma, eficiente y práctico en Golang

Una herramienta de línea de comandos multiplataforma para ejecutar trabajos en paralelo

🦖 ClawBio - La primera biblioteca de habilidades de agentes de IA nativa para bioinformática. Local-first. Reproducible. Abierta. Gratuita.

Un co-científico de IA que se ejecuta en tu escritorio. Claude Science pero mejor.

Visualización circular en Python (gráfico Circos, diagrama de acordes, gráfico de radar)

Pipelines robustos, flexibles y eficientes en el uso de recursos utilizando Go y la línea de comandos.

Entorno de trabajo de escritorio de código abierto, local-first, para investigación en computación científica con Python/R, herramientas bioinformáticas MCP, entornos de ejecución SSH/WSL/GPU y modelos de OpenAI/Anthropic.

Un componente React de plotly.js de Plotly 📈

Scripts para descargar genomas desde los servidores FTP de NCBI.

Motor de flujo de trabajo científico diseñado para la simplicidad y la escalabilidad. Transición sencilla desde casos de uso únicos hasta entornos de producción a gran escala

Dataframes genómicos nativos de la nube y computación por lotes

ADAM es una plataforma de análisis genómico con formatos de archivo especializados construidos usando Apache Avro, Apache Spark y Apache Parquet. Licenciado bajo Apache 2.

Una biblioteca integral para biología molecular computacional

Biblioteca de C para formatos de datos de secuenciación de alto rendimiento

Potencia modelos de lenguaje grandes (LLM) mediante generación aumentada por recuperación basada en grafos de conocimiento (KG-RAG) para tareas intensivas en conocimiento

Cuantificación a nivel de transcrito altamente precisa y extremadamente rápida a partir de lecturas de RNA-seq mediante alineación selectiva

Biblioteca de Python para facilitar el ensamblaje de genomas, la anotación y la genómica comparativa

Pysam es un paquete de Python para leer, manipular y escribir datos de genómica como archivos SAM/BAM/CRAM y VCF/BCF. Es un envoltorio ligero de la API de HTSlib, la misma que impulsa samtools, bcftools y tabix.

🔬🦞 Un colega de investigación de IA autoevolutivo para científicos. 285 habilidades, cero alucinaciones y memoria persistente.

Una lista curada de bibliotecas y software de quimioinformática.

La siguiente versión de bwa-mem.

Especificación para el Workflow Description Language (WDL).

Grafo de conocimiento de medicina de precisión (PrimeKG)

Fenotipado de plantas mediante análisis de imágenes

Un alineador de lecturas con huecos (gapped) rápido y sensible.

Contenedores de bioinformática

Hifiasm: un ensamblador con resolución de haplotipos para lecturas Hifi precisas.

Conteo de k-mers de secuencias de nucleótidos en memoria, filtrado, recorrido de grafos y más