single-cell

Liste organisée par la communauté de paquets logiciels et de ressources de données pour la cellule unique, incluant RNA-seq, ATAC-seq, etc.

Des centaines de compétences d'agents pour la recherche médicale, incluant la conception de protocoles, l'analyse de données, les perspectives probantes et la rédaction académique.

https://www.sc-best-practices.org

Bibliothèque Python pour l'analyse multi-omique, incluant le bulk, le single cell et le RNA-seq spatial.

🐟 🍣 🍱 Quantification au niveau des transcrits hautement précise et ultra-rapide à partir de lectures RNA-seq utilisant l'alignement sélectif

Une liste d'outils d'analyse scRNA-seq

Un pipeline Single-Cell de bout en bout conçu pour faciliter l'analyse et l'exploration complètes des données de cellules uniques.

Annotation des types cellulaires pour le RNA‑seq à cellule unique en utilisant le consensus multi‑LLM

pySCENIC est une implémentation Python ultra-rapide du pipeline SCENIC permettant aux biologistes de déduire des facteurs de transcription, des réseaux de régulation génique et des types cellulaires à partir de données RNA-seq sur cellule unique.

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) est un outil de visualisation de données à haute dimension.

Une collection de ressources remarquables concernant l'ensemble des omiques.

A tool for semi-automatic cell type classification