bioinformatics

주석이 달린 데이터셋

심층 시퀀싱 데이터를 처리하고 분석하기 위한 도구

bulk RNA-seq DEA를 위한 DESeq2 파이프라인의 Python 구현체입니다.

마이크로바이옴 분석을 위한 다목적 오픈 소스 도구

pandas DataFrame에서 분자 구조를 다루기 위한 도구

유기체 엔지니어링을 위한 Go 패키지.

초고속 및 메모리 효율적인 (메타)게놈 어셈블러

Protein-Ligand Interaction Profiler - Schake, Bolz 등(2025)의 연구에 따라 PDB 파일 내 비공유 단백질-리간드 상호작용을 분석 및 시각화합니다.

:eye: DNA 서열 기능(예: Genbank 파일)을 시각화하기 위한 Python 라이브러리

3세대 시퀀싱을 이용한 구조 변이 검출기

Cytoscape.js 기반의 Python 및 Dash용 대화형 네트워크 시각화 도구입니다.

박테리아 게놈, MAG 및 플라스미드의 신속하고 표준화된 주석 도구

ScienceClaw는 LangChain DeepAgents와 AIO Sandbox 인프라로 구축된 개인 연구 보조 도구로, OpenClaw를 넘어선 완전히 새로운 아키텍처를 채택했습니다. 더 강력한 보안, 향상된 투명성, 사용자 친화적인 경험을 제공합니다.

다중 LLM 합의를 이용한 단일 세포 RNA-seq 세포 유형 주석

유전자 클러스터 비교 도표 생성기

scikit-learn과 호환되는 그래프 커널 라이브러리

BioJava는 생물학적 데이터 처리를 위한 Java 라이브러리를 제공하는 오픈소스 프로젝트입니다.

원격 단백질 상동성 탐지 제품군

BioMCP: 생명과학 모델 컨텍스트 프로토콜

GTDB-Tk: 세균 및 고세균 게놈에 객관적인 분류학적 등급을 할당하기 위한 툴킷

SAM/BAM 데이터를 다루기 위한 도구.

편집 거리(Levenshtein distance)를 사용한 시퀀스 정렬을 위한 경량의 고속 C/C++ 및 Python 라이브러리

Chemistry Development Kit

또 다른 중복 워크플로우 엔진

WGS / 표적 시퀀싱에서 생식세포 또는 체세포 변이(전처리, 변이 호출 및 주석)를 감지하기 위한 분석 파이프라인

신속한 반수체 변이 호출 및 핵심 게놈 정렬

Biostar Q&A

시퀀싱 리드에서 어댑터 서열을 제거하는 Cutadapt

COBRApy는 대사 네트워크의 제약 기반 모델링을 위한 패키지입니다.

Dash용 오픈소스 생물정보학 컴포넌트