bioinformatics

Biblioteca de grafos de proteínas

Um kit de ferramentas de Deep Learning para DTI, propriedades de fármacos, PPI, DDI e previsão de função proteica (bioinformática).

Um kit de ferramentas CSV/TSV multiplataforma, eficiente e prático em Golang

Uma ferramenta de linha de comando multiplataforma para executar tarefas em paralelo.

🦖 ClawBio - A primeira biblioteca de skills de IA nativa em bioinformática. Foco local. Reproduzível. Aberto. Gratuito.

Um co-cientista de IA rodando no seu desktop. Claude Science, mas melhor.

Visualização circular em Python (Circos Plot, Chord Diagram, Radar Chart).

Pipelines robustos, flexíveis e eficientes em termos de recursos usando Go e a linha de comando

Workbench de pesquisa de IA desktop de código aberto e local-first para computação científica com Python/R, ferramentas de bioinformática MCP, runtimes SSH/WSL/GPU e modelos OpenAI/Anthropic.

Um componente React do plotly.js da Plotly 📈

Scripts para baixar genomas dos servidores FTP do NCBI

Mecanismo de fluxo de trabalho científico projetado para simplicidade e escalabilidade. Transição fácil entre casos de uso únicos e ambientes de produção em larga escala.

Dataframes genômicos nativos da nuvem e computação em lote

ADAM é uma plataforma de análise genômica com formatos de arquivo especializados construída usando Apache Avro, Apache Spark e Apache Parquet. Licenciado sob Apache 2.

Uma biblioteca abrangente para biologia molecular computacional

Biblioteca C para formatos de dados de sequenciação de alto rendimento

Capacite Grandes Modelos de Linguagem (LLM) usando Geração Aumentada por Recuperação baseada em Grafos de Conhecimento (KG-RAG) para tarefas intensivas em conhecimento

🐟 🍣 🍱 Quantificação de nível de transcrito altamente precisa e extremamente rápida a partir de leituras de RNA-seq usando alinhamento seletivo

Biblioteca Python para facilitar montagem de genoma, anotação e genômica comparativa

Pysam é um pacote Python para ler, manipular e escrever dados genômicos como arquivos SAM/BAM/CRAM e VCF/BCF. É um wrapper leve da API HTSlib, a mesma que alimenta samtools, bcftools e tabix.

🔬🦞 Um colega de pesquisa de IA autoevolutivo para cientistas. 285 habilidades, zero alucinação, memória persistente.

Uma lista com curadoria de bibliotecas e softwares de quimioinformática.

A próxima versão do bwa-mem

Especificação para a Workflow Description Language (WDL).

Grafo de Conhecimento de Medicina de Precisão (PrimeKG)

Fenotipagem de plantas com análise de imagem.

Um alinhador de leituras com lacunas (gapped), rápido e sensível

Hifiasm: um montador resolvido por haplótipo para leituras Hifi precisas

Containers para bioinformática.

Contagem de k-mers de sequências de nucleotídeos em memória, filtragem, travessia de grafos e mais