bioinformatics

Dados anotados.

Ferramentas para processar e analisar dados de sequenciamento profundo.

Uma implementação em Python do pipeline DESeq2 para DEA de RNA-seq em massa.

Ferramenta versátil de código aberto para análise de microbioma

Trabalhando com estruturas moleculares em pandas DataFrames

Um pacote Go para engenharia de organismos.

Montador de (meta)genomas ultrarrápido e eficiente em memória

Protein-Ligand Interaction Profiler - Analise e visualize interações proteina-ligante não covalentes em arquivos PDB de acordo com 📝 Schake, Bolz, et al. (2025), https://doi.org/10.1093/nar/gkaf361

Biblioteca Python para plotar recursos de sequências de DNA (por exemplo, a partir de arquivos Genbank)

Visualização de rede interativa em Python e Dash, alimentada por Cytoscape.js

Identificador de variação estrutural usando sequenciamento de terceira geração

Anotação rápida e padronizada de genomas bacterianos, MAGs e plasmídeos.

ScienceClaw é um assistente de pesquisa pessoal construído com LangChain DeepAgents e infraestrutura AIO Sandbox, adotando uma arquitetura totalmente nova além do OpenClaw. Oferece maior segurança, melhor transparência e uma experiência mais amigável.

Anotação de tipo de célula para RNA-seq de célula única usando consenso de múltiplos LLM

Gerador de figuras de comparação de clusters gênicos

Uma biblioteca compatível com scikit-learn para kernels de grafos

BioJava é um projeto de código aberto dedicado a fornecer uma biblioteca Java para processamento de dados biológicos.

Suíte de detecção remota de homologia de proteínas.

BioMCP: Biomedical Model Context Protocol

GTDB-Tk: um kit de ferramentas para atribuir classificações taxonômicas objetivas a genomas bacterianos e arqueanos.

Ferramentas para trabalhar com dados SAM/BAM

Biblioteca C/C++ (& Python) leve e super rápida para alinhamento de sequências usando distância de edição (Levenshtein).

The Chemistry Development Kit

Pipeline de análise para detectar variantes germinativas ou somáticas (pré-processamento, chamada de variantes e anotação) a partir de sequenciamento WGS / direcionado

Mais um motor de fluxo de trabalho redundante

:scissors: :zap: Chamada rápida de variantes haploides e alinhamento de genoma central

Perguntas e Respostas do Biostar

O Cutadapt remove sequências adaptadoras de leituras de sequenciamento

: COBRApy é um pacote para modelagem baseada em restrições de redes metabólicas.

Componentes de bioinformática de código aberto para Dash