single-cell

社区策划的单细胞软件包与数据资源清单，包括RNA-seq、ATAC-seq等

数百个用于医学研究的代理人技能，包含协议设计、数据分析、证据洞察与学术写作。

https://www.sc-best-practices.org

一个用于多组学（包含大量、单细胞与空间 RNA-seq 分析）的 Python 库。

🐟 🍣 🍱 使用选择性比对技术，从 RNA-seq 读取数据进行极度精准且超快速的转录本层级定量分析

scRNA-seq 分析工具列表

一个端到端的单细胞分析流程，旨在促进单细胞数据的全面分析与探索。

使用多 LLM 共识进行单细胞 RNA-seq 的细胞类型注释

pySCENIC 是 SCENIC 管道（单细胞调控网络推断与分群）的极速 Python 实现，使生物学家能够从单细胞 RNA-seq 资料中推断转录因子、基因调控网络与细胞类型。

PHATE (Potential of Heat-diffusion for Affinity-based Transition Embedding) 是一款用于可视化高维数据的工具。

关于所有组学 (Omics) 的精选资源集合。

一种用于半自动细胞类型分类的工具