bioinformatics

计算机科学课程与视频讲座列表

将任何 AI 代理人转变为 AI 科学家。全球超过 175,000 名科学家使用的首选代理技能库，提供 163 个即用验证技能与 100 多个涵盖生物、化学、医学与药物发现的科学数据库。兼容 Cursor、Claude Code、Codex、Pi、Antigravity 以及开放的 Agent Skills 标准。

Python 的数据应用与仪表板，无需 JavaScript

Biopython 官方 git 仓库（最初从 CVS 转换而来）

精选优秀生物信息库与软件清单

具备科学代理（scientific agents）的开源 AI 研究工作台，用于可重复的研究与发现。

社区策划的单细胞软件包与数据资源清单，包括RNA-seq、ATAC-seq等

DeepVariant 是一个分析流程，利用深度神经网络从下一代 DNA 测序资料中调用基因变异

面向科学研究的开源 AI 工作台。

面向数据驱动计算管道的 DSL

让蛋白质折叠变得人人可及！

Python 中的单细胞分析。可扩展至超过 1 亿个细胞。

超快速的全能型 FASTQ 预处理工具（包含 QC、接头处理、修剪、过滤、拆分、合并等...）

适用于基因组和剪接核苷酸序列的多功能成对比对工具

MMseqs2：超快且灵敏的搜索与聚类套件

GATK 4 及以上版本的官方代码库

用于科学／生物医学文件的完整 spaCy 管道与模型。

精选的 AI 工具、库、论文、数据集与框架清单，加速从物理、化学到生物、材料及其他领域的科学发现。

bioconda 频道用的 Conda 软件包配方。

人人可用的数据密集型科学。

数百个用于医学研究的代理人技能，包含协议设计、数据分析、证据洞察与学术写作。

用于短序列比对的 Burrow-Wheeler Aligner（长序列比对请见 minimap2）

一个跨平台且超快速的 FASTA/Q 文件处理工具包

用于处理 FASTA/Q 格式序列的工具包

将跨多个样本的生物信息学分析结果汇总成单一报告。

用于基因组学与数据科学的 Unix、R 与 Python 工具

Foldseek 能够对大型结构集进行快速且灵敏的比对。

治疗学共用平台 (TDC)：治疗科学的多模态基础

scikit-bio：社区驱动的生物信息学 Python 库，提供多样化的数据结构、算法和教育资源。

一个用于多组学（包含大量、单细胞与空间 RNA-seq 分析）的 Python 库。