transcriptomics

Python 中的单细胞分析。可扩展至超过 1 亿个细胞。

🧬 gget 实现对基因组参考数据库的高效查询

用于基因组学与转录组学的基础模型

单细胞转录组学数据的交互式探索工具

标注数据。

用于 bulk RNA-seq DEA 的 DESeq2 pipeline 之 Python 实现。

pySCENIC 是 SCENIC 管道（单细胞调控网络推断与分群）的极速 Python 实现，使生物学家能够从单细胞 RNA-seq 资料中推断转录因子、基因调控网络与细胞类型。